Para crear un enlace a o desde una subpágina, usualmente puede usar un WikiLink normal que no contenga el nombre del directorio superior de la subpágina. Ikiwiki desciende por la jerarquía de directorios buscando una página que se corresponda con su enlace.

Por ejemplo, si «FooBar/SubPagina» enlaza a «OtraPagina», ikiwiki preferirá primero dirigir el enlace a «FooBar/SubPagina/OtraPagina» si existe, a continuación a «FooBar/OtraPagina», y finalmente a «OtraPagina» en el directorio raíz del wiki.

Tenga en cuenta que esto significa que si un enlace en «FooBar/AlgunaPagina» a «OtraPagina» enlaza actualmente a «OtraPagina» en el directorio raíz del wiki, y se crea «FooBar/OtraPagina», el enlace cambiará para dirigir a «FooBar/OtraPagina». Por otra parte, un enlace desde «BazBar» a «OtraPagina» no cambiará por esta creación de una subpágina de «FooBar».

También puede especificar un enlace que contenga un nombre de directorio, como «FooBar/OtraPagina» para especificar con más exactitud a qué página enlazar. Ésta es la única manera de enlazar a una subpágina no relacionada.

Puede utilizar esto, por ejemplo, para enlazar desde «BazBar» a «FooBar/SubPagina», o desde «BazBar/SubPagina» a «FooBar/SubPagina».

También puede utilizar «/» al principio de un enlace, para especificar exactamente a qué página enlazar, cuando existen múltiples páginas con nombres similares y el enlace conduce a la página equivocada de manera predeterminada. Por ejemplo, crear un enlace desde «FooBar/SubPagina» a «/OtraPagina» conducirá a la «OtraPagina» del directorio raíz del wiki, incluso aunque haya una «FooBar/OtraPagina».

Además, si el wiki está configurado con un directorio «userdir», puede enlazar a páginas dentro del «userdir» sin especificar una ruta hasta ellas. Esto ocurre para permitir la creación sencilla de enlaces a la página de un usuario en el «userdir», para firmar un comentario. Estos enlaces se comprueban en último lugar.